中山大学（广州）和大连理工大学（大连）表达了与托木斯克国立大学合作的兴趣。已于12月初与第一所大学签署了意向协议，并计划在不久的将来与第二所大学签署类似的文件。预计随着合作的深入，托木斯克与中国高校将在林业、物理、化学、信息技术等领域开展联合办学项目。
目前，中山大学和大连理工大学是托木斯克国立大学目前合作的中国高校中最具权威和知名度的高校。中山大学跻身世界前300：QS排名第267位（TSU目前排名第264位）。同时，根据QS学科排名，这所大学哲学排名第48位，地理学位列101-150位，地球物理学、历史学、数学、地质学、生物科学和化学位列151-200位。它还在其他主要领域名列前茅：WUR 学科排名第248位，毕业生就业能力排名第201-250位，亚洲大学排名第44位，世界大学学术排名（上海排名）第79位。
托国立对大连理工大学更有合作意愿。在QS全球最强大学综合排名中，其位置在前十名561-570之间。然而，与此同时，这所大学在化学技术学科排名中排名前150，物理和技术方向排名前250，化学排名前200，材料科学排名前200。
托国立国际关系副校长阿尔乔姆·瑞昆（Artem Rykun）评价到：大连理工大学是一所非常强大的工科大学。他在学科排名上的表现，说明他们在这些学科领域有设备，而且那里的学生水平很高。总的来说，这两所大学都是可以因与之合作而感到自豪的大学。因此，他们也为与托国立的合作感到自豪。必须说，与这些大学的协议是由中方发起的，也就是说，这些大学打算与我们发展合作。
目前，托木斯克国立大学、中山大学和大连理工大学已签署意向协议。下一阶段将就合作领域提出具体建议。中山大学一直有兴趣与托国立合作开展林业教育项目。
此外，毕业于托国立语言学系的鞠传雅也在该大学担任俄语教师。考虑到在中国大学求职难度大，申请者之间竞争激烈，这样的就业事实表明中山大学对托国立毕业生的水平给与肯定。
在与大连理工大学合作中，最有可能的是与托国立物理与技术学院开展合作。未来，IT领域和化学学院也可能加入合作。
而且，在大连理工大学所在的辽宁省，还有一所于托国立合作最久的合作伙伴—沈阳理工大学。 2022年期间，托木斯克国立大学与国外大学签订并续签了18项协议。